50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4386 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  58.33 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  57.41 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  59 
 
 		 105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  59 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  54.63 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  52.21 
 
 		 114 aa  123  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  53.27 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  53.7 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  56.19 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  54.29 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  51.85 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  48.65 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  49.49 
 
 		 117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  45.61 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  49.46 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  54.95 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  58.14 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  52.81 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  43.52 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  40.95 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  53.85 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  44.79 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  38.66 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  37.86 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  53.19 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  32.69 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  34.29 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  34.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  31.43 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  28.28 
 
 		 112 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>