52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1110 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  82.91 
 
 		 117 aa  204  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  82.05 
 
 		 117 aa  203  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  82.05 
 
 		 117 aa  203  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  93.33 
 
 		 91 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  68.87 
 
 		 123 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  66.67 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  67.62 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  66.04 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  60 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  64.08 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  58.04 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  56.07 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  60.95 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  70.93 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  63.22 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  47.66 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  43.52 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  43.52 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  44.12 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  49.51 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  43.93 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  44.12 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  46.36 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  50 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  60 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  40.54 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  52.83 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  39.81 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  36.11 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  36.19 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  33.02 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  36.45 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  34.78 
 
 		 121 aa  57  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  29.09 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  35.63 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  41.1 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.29 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  31.48 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  31.37 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  37.29 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  33.82 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  28.72 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  28.42 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>