42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1359 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  64.71 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  68.75 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  58.82 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  62.5 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  58.21 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  62.5 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  63.49 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  60 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  61.54 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  52.94 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  54.41 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  54.41 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  56.06 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  54.41 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  56.92 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  56.92 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  56.92 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  55.88 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  55.07 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  59.38 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  53.85 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  70.59 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  62.96 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  55.81 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  38.71 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  42.86 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  38.1 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  42.11 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  41.51 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40.82 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  44.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  43.86 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  37.31 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  41.51 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  43.64 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.7 
 
 		 113 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>