58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4237 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  249  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  98.33 
 
 
120 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  97.14 
 
 
105 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  97.14 
 
 
105 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  57.52 
 
 
114 aa  146  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  61.11 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  57.55 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  57.41 
 
 
116 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  52.38 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  48.62 
 
 
112 aa  124  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  47.83 
 
 
118 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  48.62 
 
 
123 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  51.46 
 
 
112 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  47.22 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  51.43 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  46.23 
 
 
117 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  43.52 
 
 
109 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  46.23 
 
 
117 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  43.52 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  47.52 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  51.11 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  47.12 
 
 
108 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  51.72 
 
 
103 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  41.76 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  44.12 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  39.25 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  42.31 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  62.07 
 
 
73 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  39.05 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  40.62 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  34.23 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  36.27 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  41.38 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.86 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  32.41 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  40.48 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  42.11 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  25.71 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  32.26 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  36.51 
 
 
106 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  32.26 
 
 
103 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  38.6 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  35.09 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  29.35 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.09 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  29.57 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  31.15 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>