45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_D2815 on replicon NC_007617
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  78.99 
 
 
125 aa  189  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  59.29 
 
 
127 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  60.87 
 
 
121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  60.71 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  59.63 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  58.56 
 
 
119 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  56.76 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  53.78 
 
 
128 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  50.41 
 
 
138 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  56.07 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  50.43 
 
 
123 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  54.05 
 
 
121 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  43.52 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  51.9 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  43.27 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  41.03 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  42.31 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  39.82 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  41 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  44.44 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  42.27 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  38.94 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  40.45 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  37.61 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  40.45 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  35.45 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  35.34 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  37.38 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  40.22 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2859  hypothetical protein  68.18 
 
 
49 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  37.25 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  48.33 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  35.63 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  38.54 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>