75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3516 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  78.57 
 
 
123 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  75.7 
 
 
112 aa  175  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  71.03 
 
 
114 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  72.64 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  67.86 
 
 
112 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  68.18 
 
 
112 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  67.62 
 
 
117 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  65.38 
 
 
117 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  65.09 
 
 
117 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  64.15 
 
 
117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  77.91 
 
 
107 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  60 
 
 
112 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  67.05 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  58.65 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  63.33 
 
 
103 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  54.81 
 
 
108 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  52.78 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  51.43 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  52.53 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  51.43 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  52.53 
 
 
105 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  51.85 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  51.43 
 
 
115 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  55.43 
 
 
102 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  62.5 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  38.39 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  39.22 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  40.59 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  58 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  35.78 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  35.34 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  33.01 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  35.78 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  31.78 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  35.24 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  33.98 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  33.93 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  31.91 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  31.58 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  36 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  36.67 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  43.33 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  38.71 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  34.85 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  34.07 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  31.91 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  38.71 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  36.23 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  38.98 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  38.98 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  38.98 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  32.63 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  34.43 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  36.21 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  37.29 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  34.78 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  34.78 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  30.68 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  39.34 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  33.72 
 
 
111 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  38.78 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  44.19 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  32.93 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  32.47 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  34.43 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  37.04 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>