49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4336 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  93.33 
 
 
117 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  84.44 
 
 
117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  84.44 
 
 
117 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  83.33 
 
 
117 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  67.05 
 
 
113 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  68.6 
 
 
123 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  64.77 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  64.77 
 
 
114 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  61.36 
 
 
112 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  62.79 
 
 
118 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  57.3 
 
 
112 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  64.71 
 
 
112 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  72.46 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  68.57 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  51.72 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  53.09 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  42.86 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  51.72 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  42.86 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  47.13 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  41.76 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  50.6 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  52.83 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  37.35 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  35.23 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  42.67 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  40.66 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  38.37 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  36.11 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  35.71 
 
 
128 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  41.54 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  38.27 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  38.27 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  40.28 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  42.62 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  34.25 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  42.62 
 
 
71 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  33.82 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  34.72 
 
 
113 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  32.35 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>