43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0767 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  61.95 
 
 
121 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  56.3 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  62.73 
 
 
123 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  59.63 
 
 
128 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  60.19 
 
 
125 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  55.05 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  56.48 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  53.7 
 
 
127 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  57.28 
 
 
113 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  48.25 
 
 
123 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  52.88 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  52.59 
 
 
127 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  65.28 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  45.1 
 
 
120 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  44.12 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  42.45 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  44.33 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  43.3 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  44.79 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  39.05 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  38.68 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  43.81 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  40.59 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  40.54 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  40.59 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  43.68 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  40.57 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  42.17 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  34.91 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  35.24 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  41.67 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  36.78 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  40.66 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  30.61 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  41.86 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>