45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2998 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  78.99 
 
 		 128 aa  189  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  69.16 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  64.49 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  60 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  64.15 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  59.63 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  60.19 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  57.41 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  55.96 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  44.72 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  47.97 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  47.32 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  47.79 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  55.7 
 
 		 82 aa  84.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  42.7 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40.38 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  39.05 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  41.35 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  35.78 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2859  hypothetical protein  65.96 
 
 		 49 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  36.7 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  38.14 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  37.11 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  35.63 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  37.25 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  40.68 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>