49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3746 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  55.75 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  57.55 
 
 
128 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  59.62 
 
 
121 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  55.66 
 
 
123 aa  119  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  53.1 
 
 
119 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  52.17 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  52.88 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  52.94 
 
 
123 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  54.05 
 
 
128 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  51.3 
 
 
127 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  50.98 
 
 
113 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  49.5 
 
 
117 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  47.97 
 
 
125 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  66.2 
 
 
82 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  46.09 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  38.39 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  38.68 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  37.61 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  36.04 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  37.62 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  34.91 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  36.63 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  34.23 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  34 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  33.64 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  33.61 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  35.14 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  33.02 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  35.96 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  36.89 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  31.78 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  36.63 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  36.47 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  35.23 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  36.49 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  28.85 
 
 
190 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  29.81 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  38.46 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  42.22 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  27.45 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  27.18 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>