42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3586 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  168  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  67.07 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  66.2 
 
 
121 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  64.38 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  65.28 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  58.02 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  61.33 
 
 
127 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  58.11 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  63.89 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  53.16 
 
 
123 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  55.41 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  55.7 
 
 
125 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  51.9 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  54.17 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  45.45 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  48.72 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  41.1 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  34.18 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  41.54 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  35.38 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  37.14 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  34.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  36.76 
 
 
118 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.88 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  39.58 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  38.46 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  37.88 
 
 
102 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  37.88 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  31.43 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  31.43 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  31.43 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  35.85 
 
 
107 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  39.22 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>