66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1023 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  224  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  58.1 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  57.69 
 
 
123 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  54.81 
 
 
113 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  53.33 
 
 
112 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  53.33 
 
 
112 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  56.07 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  52.94 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  58.89 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  49.51 
 
 
117 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  53.06 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  51.96 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
114 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  50.98 
 
 
117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  48.08 
 
 
120 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  48.48 
 
 
105 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  48.48 
 
 
105 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  47.12 
 
 
120 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  53.33 
 
 
102 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  53.09 
 
 
91 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  52.94 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  44.86 
 
 
114 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  56.06 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.9 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  43.14 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  38.83 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  64.58 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  35.58 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  42.16 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  43.14 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  35.79 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  37.25 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  41.58 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  34.91 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  36.67 
 
 
117 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  36.79 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  37.25 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  37.86 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1559  hypothetical protein  72.5 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981754 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  38.16 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  38.67 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  40.68 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  40.68 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  41.38 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.7 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.48 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  39.19 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  34.43 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  38.33 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  41.38 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  36.21 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  36.36 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  37.21 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  32.79 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  34.43 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  34.43 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  34.43 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  40.91 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  31.67 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  35.09 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>