53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0550 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
102 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  56.25 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  56.25 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  54.95 
 
 
116 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  57.61 
 
 
112 aa  104  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  57.45 
 
 
118 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  51.06 
 
 
109 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  55.43 
 
 
112 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  55.43 
 
 
113 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  53.33 
 
 
108 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  52.13 
 
 
112 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  60.49 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  51.65 
 
 
117 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  51.65 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  51.65 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  64.71 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  48.94 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  58.54 
 
 
107 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  48.94 
 
 
105 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  48.94 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  49.48 
 
 
114 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  50.53 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  50.6 
 
 
91 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  41.67 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  36.63 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  40.43 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  39.58 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  38.54 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  40.86 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  48.84 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  35.42 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  32.26 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  40.82 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  31.68 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  32.79 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  33.68 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  31.91 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  41.94 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  32.79 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  34.41 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  37.88 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  34.07 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  28.09 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  31.87 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>