45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1384 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  236  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  59.09 
 
 		 119 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  66.35 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  59.63 
 
 		 125 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  63.46 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  61.11 
 
 		 121 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  56.76 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  59.22 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  57.28 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  56.86 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  50.98 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  50.96 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  45.79 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  55.41 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  43 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  38.78 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  40.4 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  40.96 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  40.48 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  38.83 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  37.76 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  39.76 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  33.73 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  40.66 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  33.73 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  32.35 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  36.08 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.37 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  39.19 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  37.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  31.37 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  34.41 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  34.72 
 
 		 91 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  26.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2859  hypothetical protein  48.78 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>