57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0998 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  94.64 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  62.07 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  62.07 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  62.07 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  62.07 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  70 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  64 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  64 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  60 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  58 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  57.69 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  57.69 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  57.69 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  58 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  52.83 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  52.83 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  59.18 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  56.6 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  64.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  57.45 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  53.19 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  48.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  55.81 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  48.84 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  57.14 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  49.02 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  48.94 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  44.68 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  40.68 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  41.86 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  44.26 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1559  hypothetical protein  64.71 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  45.83 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  32.86 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  42.55 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  42.22 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  38.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  40.91 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  39.22 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  30 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  38.64 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  43.18 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  43.18 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  37.78 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  38.64 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  41.86 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>