84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1108 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  77.78 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  74.07 
 
 		 123 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  71.03 
 
 		 113 aa  167  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  69.37 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  68.22 
 
 		 117 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  67.29 
 
 		 117 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  67.29 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  66.36 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  65.42 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  66.04 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  77.91 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  60.95 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  57.84 
 
 		 109 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  64.77 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  62.92 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  47.22 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  47.22 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  49.49 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  49.49 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  50.96 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  50 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  45.61 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  50 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  68.75 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  40.38 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  64 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  35.19 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  35.45 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  35.24 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  36.79 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  33.02 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  35.58 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  36.21 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  30.48 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  35.87 
 
 		 121 aa  57  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  31 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  30 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  37.78 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  36.26 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  31.31 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  42.37 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  31.37 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  31.48 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  32.98 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  32.61 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  38.98 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  30.85 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  36.05 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  29.79 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  32.98 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  33.8 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  34.38 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  33.72 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  43.14 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  33.75 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  33.9 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  33.9 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4346  hypothetical protein  52 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11309  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  36.51 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  31.15 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  33.9 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  45.16 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  32.79 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  27.36 
 
 		 109 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  35.85 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  37.29 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  44.19 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>