31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0275 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  95.77 
 
 		 71 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  46.03 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  45.16 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  43.55 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  40.68 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  42.62 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  39.06 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  39.06 
 
 		 117 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  39.06 
 
 		 117 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  36.92 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  41.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  37.1 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  37.1 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  36.51 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  32.79 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  37.1 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  41.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  37.1 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  43.9 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  37.7 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  35.94 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  38.6 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  33.85 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  34.92 
 
 		 127 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  31.58 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>