63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3410 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  65.56 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  57.28 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  47.57 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  43.69 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  41.35 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  36.54 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  34.95 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  37.86 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  37.5 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.92 
 
 		 190 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  36.08 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  37.62 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  34 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  34.65 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  40.66 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  40.66 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  34.48 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  38.46 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  33.01 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  52.73 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  39.56 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  39.36 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  37.76 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  32.43 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  37.36 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  45.76 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  41.38 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  42.86 
 
 		 56 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  44.68 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  40.74 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  36.21 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  33.7 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  33.75 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  36.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  36.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  37.7 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  36.51 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  38.75 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3492  protein of unknown function DUF891  28.23 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.603175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  30.43 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  37.7 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  34.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  37.93 
 
 		 111 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  34.55 
 
 		 118 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  27.08 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  32.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  32.2 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  41.86 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  31.46 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>