44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0745 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  216  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  59.22 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  47.06 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  47.06 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  47.06 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  46.08 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  47.06 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  47.06 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  41.18 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  37.11 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  35.05 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  36 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  33.66 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  40.4 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  34.95 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  34.02 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.76 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  32.99 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  32.04 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  32.04 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  32 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  32.08 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  40.91 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  31.18 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  31.03 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  29.81 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  29.63 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  31.36 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  32.29 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  36.26 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  41.27 
 
 		 115 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  42.37 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  41.82 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  26.09 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  42.37 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  30.48 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>