54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1816 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  246  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  40.19 
 
 
107 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  41.94 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  41.49 
 
 
190 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  43.16 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  43.16 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  43.16 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  41.05 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  42.05 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  40.86 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  35.64 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  38.04 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  36.96 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  39.78 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  40.38 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  40.38 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  36.26 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  40.38 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  33.65 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  39.42 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  32.29 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  29.13 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  32.69 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.11 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  32.95 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  35 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  32.71 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  30.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  31.91 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  43.86 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  40.68 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  40.35 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  28.57 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  36.07 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  41.57 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  35.09 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  36.92 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  37.74 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  35.09 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  39.22 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  34.43 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  29.79 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  35.71 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  37.14 
 
 
118 aa  40.8  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  36.23 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  43.18 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>