60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0118 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  100 
 
 
106 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  86.44 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  72.88 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  72.88 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  72.88 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  66.67 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  62.71 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  55.74 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  64.41 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  59.32 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  62.3 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  57.14 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  57.14 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  50.85 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  56.14 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  57.14 
 
 
56 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  57.14 
 
 
56 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  57.14 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  51.72 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  52.73 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  49.12 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  42.37 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  49.12 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  47.37 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  50 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  48.15 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  38.33 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  44.83 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  42.11 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  42.11 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  51.06 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  42.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  45 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  43.86 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  43.86 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  50.85 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  35.38 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  50.85 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  36.51 
 
 
120 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  36.51 
 
 
120 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  36.51 
 
 
105 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  36.51 
 
 
105 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  40.74 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  37.7 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  39.58 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  36.51 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  38.6 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  34.92 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  41.82 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  36.84 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  39.34 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  41.3 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  33.96 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  37.74 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  32.31 
 
 
112 aa  40  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  31.87 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  42 
 
 
111 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>