54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2041 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  223  6e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  45.28 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  44.12 
 
 
113 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  40.57 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  32.08 
 
 
190 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  40.57 
 
 
108 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  40.57 
 
 
108 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  40.57 
 
 
108 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  38.68 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  42 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  36.19 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  34.91 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  41 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  42.11 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  41.94 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  34.62 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  38.78 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  34.95 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  43.18 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  36 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  31.73 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  38.68 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  35.05 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  37.25 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  37.25 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  32.29 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  32.29 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  42.37 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  31.11 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  32.61 
 
 
119 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  51.92 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  34.62 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  56.52 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  33.66 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  29.52 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  31.58 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  29.9 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  29.13 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  23.42 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  24 
 
 
108 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  24 
 
 
108 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  25.53 
 
 
122 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  24 
 
 
108 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>