62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0656 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
111 aa  227  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  80.91 
 
 
111 aa  193  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  79.63 
 
 
116 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  72.22 
 
 
116 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  60.75 
 
 
119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  58.88 
 
 
119 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  59.81 
 
 
119 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  57.94 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  57.94 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  57.28 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  57.01 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  53.27 
 
 
119 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  53.27 
 
 
118 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  54.21 
 
 
134 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  45.37 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  44.04 
 
 
115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  32.38 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  43.94 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  31.13 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  42.25 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  47.54 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  40.54 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  46.38 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  31.86 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  40.54 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  40.85 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  30.48 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  41.79 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  37.14 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  38.57 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  38.03 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  36.92 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  31.07 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  37.78 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  30.1 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.21 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  38.57 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  38.57 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  41.18 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  36.67 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  32.31 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  27.1 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  36.21 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  32.22 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  48.89 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  48.89 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  34.44 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  28.09 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  32.22 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  37.74 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  35.71 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
106 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>