25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3723 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  32.99 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  29.47 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  30.84 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  33.66 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  32.98 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  30.67 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  28.89 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  26.97 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  29.63 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  29.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  27.96 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  28.92 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  25.53 
 
 		 109 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  30.86 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  31.25 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  31.25 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  28.72 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  29.41 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  30.53 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  26.09 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  30.21 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>