20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0946 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  99.07 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  99.07 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  30.84 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  32.08 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  28.3 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  28.97 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  31.48 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  26.85 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  26.85 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  26.85 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  30.84 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  26.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  27.1 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  28.04 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  25.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  28.7 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  24 
 
 		 109 aa  42  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  26.09 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>