22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0891 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  99.07 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  33.02 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  31.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  33.02 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  29.25 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  32.41 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  28.97 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  31.78 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  27.62 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  28.04 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  28.97 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  25.71 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  26.42 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  24.76 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  24 
 
 		 109 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  26.09 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>