44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3583 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  95.8 
 
 		 119 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  88.24 
 
 		 119 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  87.39 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  87.39 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  86.55 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  67.65 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  65.71 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  60.75 
 
 		 111 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  62.26 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  56.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  47.12 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  47.12 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  50.46 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  47.57 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  49.51 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  28.43 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  40.32 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  29.13 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  36.99 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  36.99 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  35.62 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  38.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  24.11 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  36.76 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  34.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  35.62 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  35.14 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  27.62 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  37.68 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  32.43 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  32.98 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  32.43 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.62 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  35.21 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  35.71 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  33.73 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  30.69 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  32.93 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  33.82 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>