39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3341 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  95.97 
 
 
124 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  95.97 
 
 
124 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  91.6 
 
 
119 aa  220  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  87.39 
 
 
119 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  86.55 
 
 
119 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  64.42 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  62.86 
 
 
116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  57.01 
 
 
111 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  59.62 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  50.46 
 
 
118 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  47.57 
 
 
118 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  49.54 
 
 
134 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  44.76 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 
115 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  45.63 
 
 
119 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  41.94 
 
 
72 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  30.1 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  27.1 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  35 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  38.03 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  26.61 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  24.11 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.91 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  36.23 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  24.39 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  31.08 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  38.57 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  31.94 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  30.69 
 
 
121 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>