17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7028 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7028  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8281  hypothetical protein  47.83 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0888  hypothetical protein  42.72 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4383  Protein of unknown function DUF2137  39.42 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3255  hypothetical protein  37.63 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0873  hypothetical protein  38.84 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  32.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  31.87 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  35.06 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  31.31 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  34.12 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  35.71 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  31.76 
 
 		 108 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  31.76 
 
 		 108 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>