33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0987 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  72.81 
 
 		 123 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  67.27 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  65.52 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  65.22 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  48.18 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  44.74 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  43.64 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1136  hypothetical protein  63.38 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318974  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  45.05 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  41.96 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  42.73 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  42.73 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  40.91 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  41.82 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  45.13 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  42.34 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  43.1 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  49.41 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  43.9 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  42.61 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  48.15 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  37.4 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  40.21 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  40.21 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  38.02 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  50.68 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  38.55 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  34.04 
 
 		 119 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2673  hypothetical protein  36.73 
 
 		 56 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>