30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5819 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
115 aa  234  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  80.87 
 
 
130 aa  189  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  57.52 
 
 
116 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  55.14 
 
 
127 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  53.92 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  50.43 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  53.68 
 
 
225 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  53.68 
 
 
225 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  51.96 
 
 
123 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  50.49 
 
 
201 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  51.09 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  41.75 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  42.16 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  42.31 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  40.59 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  42.39 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  47.56 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  48.19 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  45.78 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  41.46 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  43.18 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  38.38 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  38.38 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  39.76 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  40.26 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  37.8 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7028  hypothetical protein  40.96 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>