29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6665 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  58.41 
 
 
123 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  50.39 
 
 
128 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  55.86 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  55.14 
 
 
115 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  55.05 
 
 
201 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  51.75 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  49.53 
 
 
124 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  51.46 
 
 
225 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  51.46 
 
 
225 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  46.73 
 
 
114 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  42.5 
 
 
127 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  38.94 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  35.78 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  33.05 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  34.45 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  34.45 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  34.86 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  43.12 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  43.68 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  36.75 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  45.45 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  33.91 
 
 
224 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  50.68 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  38.14 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>