32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0025 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  239  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  239  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  55.36 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  51.79 
 
 
115 aa  130  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  54.39 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  51.72 
 
 
118 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  58.18 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  41.58 
 
 
224 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  42.61 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  42.11 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  42.48 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  40.71 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  42.73 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  42.11 
 
 
122 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  46.3 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  41.67 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  44.21 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  44.94 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  41.24 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  34.45 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  44.19 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  43.75 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  33.93 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  38.38 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  37.04 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 
225 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 
225 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1136  hypothetical protein  41.67 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  31.25 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2673  hypothetical protein  42.59 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>