32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8075 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  47.41 
 
 
118 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  46.09 
 
 
116 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  48.62 
 
 
112 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  46.02 
 
 
117 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  43.8 
 
 
123 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  41.58 
 
 
115 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  41.58 
 
 
115 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  45.95 
 
 
117 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  41.38 
 
 
140 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  41.07 
 
 
117 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  38.39 
 
 
115 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  36.61 
 
 
115 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  36.61 
 
 
121 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  35.25 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  38.39 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  37.17 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  37.76 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  29.84 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  37.39 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  35.25 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  39.25 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  39.08 
 
 
124 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  33.91 
 
 
127 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  39.76 
 
 
115 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1136  hypothetical protein  38.57 
 
 
88 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4383  Protein of unknown function DUF2137  35.56 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  30.93 
 
 
121 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>