29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0389 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5819  helix-turn-helix domain-containing protein  80.87 
 
 		 115 aa  189  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.608546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2881  hypothetical protein  56.78 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00385493  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7018  hypothetical protein  53.21 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  50.94 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  50.94 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6665  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4344  Protein of unknown function DUF2137  51.38 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0389295  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0628  hypothetical protein  43.48 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2394  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12057  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13204  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000225014  normal  0.415725 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1923  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.204228  normal  0.010651 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0025  hypothetical protein  42.06 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000365289  hitchhiker  0.00178909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1456  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125825  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2395  hypothetical protein  36.28 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2476  hypothetical protein  35.4 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3626  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  37.17 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0635  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5284  hypothetical protein  39.47 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0664  hypothetical protein  33.06 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  37.4 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3674  hypothetical protein  34.82 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0025  hypothetical protein  37.04 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0011  hypothetical protein  37.04 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.769725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3536  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>