More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2548 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.26 
 
 		 611 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.22 
 
 		 596 aa  664    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.44 
 
 		 592 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.93 
 
 		 605 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.3 
 
 		 591 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.02 
 
 		 607 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1550  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.26 
 
 		 595 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.61 
 
 		 592 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.47 
 
 		 591 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  68.36 
 
 		 601 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.43 
 
 		 608 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  71.28 
 
 		 596 aa  879    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  68.61 
 
 		 602 aa  852    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.4 
 
 		 590 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.43 
 
 		 589 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.43 
 
 		 589 aa  709    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  68.54 
 
 		 592 aa  843    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.4 
 
 		 590 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.9 
 
 		 616 aa  776    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  77.39 
 
 		 594 aa  967    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.09 
 
 		 592 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.1 
 
 		 605 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  60.03 
 
 		 584 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.68 
 
 		 607 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.85 
 
 		 588 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.39 
 
 		 587 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.22 
 
 		 596 aa  664    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 600 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.48 
 
 		 592 aa  882    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.43 
 
 		 603 aa  690    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.83 
 
 		 612 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.09 
 
 		 588 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.56 
 
 		 596 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.4 
 
 		 616 aa  763    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  72.19 
 
 		 587 aa  853    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.76 
 
 		 594 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.64 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.42 
 
 		 590 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.91 
 
 		 607 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.87 
 
 		 604 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.3 
 
 		 591 aa  859    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.24 
 
 		 598 aa  663    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.82 
 
 		 606 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  66.32 
 
 		 601 aa  814    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.17 
 
 		 590 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  55.13 
 
 		 638 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  68.4 
 
 		 598 aa  853    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.46 
 
 		 591 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.47 
 
 		 591 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.69 
 
 		 603 aa  677    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.43 
 
 		 590 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.68 
 
 		 607 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.23 
 
 		 616 aa  779    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.27 
 
 		 592 aa  885    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.18 
 
 		 587 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.01 
 
 		 604 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 		 597 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.37 
 
 		 588 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.07 
 
 		 596 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.1 
 
 		 611 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.18 
 
 		 611 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54 
 
 		 612 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.18 
 
 		 587 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 		 596 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2636  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 600 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.76 
 
 		 588 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.57 
 
 		 595 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.97 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.19 
 
 		 590 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.14 
 
 		 605 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.09 
 
 		 595 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.97 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.19 
 
 		 590 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56 
 
 		 605 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0088  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.65 
 
 		 600 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 		 600 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.3 
 
 		 591 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29304  predicted protein  56.16 
 
 		 633 aa  644    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 		 597 aa  1237    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.85 
 
 		 588 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.34 
 
 		 592 aa  836    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.44 
 
 		 592 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.6 
 
 		 590 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  68.19 
 
 		 602 aa  834    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  68.63 
 
 		 597 aa  845    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  67.17 
 
 		 601 aa  826    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.05 
 
 		 596 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.81 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.01 
 
 		 601 aa  821    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.08 
 
 		 600 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.5 
 
 		 596 aa  657    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>