More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3244 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  63.68 
 
 
647 aa  756    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 
591 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29304  predicted protein  66.61 
 
 
633 aa  798    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0088  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.5 
 
 
600 aa  910    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.28 
 
 
605 aa  884    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1550  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
595 aa  781    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.02 
 
 
599 aa  770    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.23 
 
 
592 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.77 
 
 
605 aa  890    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3978  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.04 
 
 
613 aa  1046    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_004310  BR1902  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.64 
 
 
613 aa  1049    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.94 
 
 
591 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.64 
 
 
597 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  66.06 
 
 
637 aa  782    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.2 
 
 
613 aa  1046    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.02 
 
 
612 aa  878    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  55.84 
 
 
594 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.27 
 
 
592 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.12 
 
 
598 aa  795    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4135  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.97 
 
 
618 aa  1031    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67 
 
 
607 aa  823    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.97 
 
 
613 aa  1054    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.15 
 
 
612 aa  877    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.59 
 
 
607 aa  840    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.17 
 
 
600 aa  909    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.38 
 
 
597 aa  877    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.3 
 
 
602 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.38 
 
 
595 aa  884    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.11 
 
 
596 aa  818    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.17 
 
 
596 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67 
 
 
603 aa  834    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.17 
 
 
594 aa  891    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0953  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.81 
 
 
614 aa  1051    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.33 
 
 
607 aa  826    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.99 
 
 
604 aa  850    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.06 
 
 
597 aa  807    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.9 
 
 
598 aa  820    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.31 
 
 
606 aa  908    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.77 
 
 
607 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  54.75 
 
 
598 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.42 
 
 
591 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.57 
 
 
592 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.61 
 
 
607 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  62.73 
 
 
638 aa  778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.28 
 
 
607 aa  825    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.75 
 
 
592 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.1 
 
 
592 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.75 
 
 
592 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74 
 
 
602 aa  907    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.29 
 
 
604 aa  864    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 
591 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.94 
 
 
591 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.08 
 
 
608 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
611 aa  1266    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.67 
 
 
595 aa  852    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76 
 
 
600 aa  934    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.5 
 
 
596 aa  852    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2957  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  82.54 
 
 
613 aa  1032    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.95 
 
 
595 aa  875    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 
591 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.61 
 
 
605 aa  887    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 
591 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.78 
 
 
596 aa  815    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.44 
 
 
611 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.83 
 
 
603 aa  878    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.77 
 
 
591 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66251  succinate dehydrogenase  64.29 
 
 
641 aa  772    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 
591 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.17 
 
 
600 aa  954    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.61 
 
 
605 aa  889    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.06 
 
 
608 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.75 
 
 
592 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.77 
 
 
591 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.82 
 
 
611 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.83 
 
 
596 aa  838    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.85 
 
 
595 aa  644    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0090  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.8 
 
 
615 aa  1017    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.16 
 
 
601 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2636  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.17 
 
 
600 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.02 
 
 
596 aa  831    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  55.42 
 
 
596 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.24 
 
 
592 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.66 
 
 
601 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.07 
 
 
591 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  52.92 
 
 
602 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.4 
 
 
597 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.72 
 
 
591 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.36 
 
 
592 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.03 
 
 
589 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.03 
 
 
589 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.16 
 
 
601 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  51.86 
 
 
592 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.38 
 
 
587 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>