151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0669 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0669  flagellar basal body L-ring protein-like protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0165935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0844  flagellar L-ring protein  52.04 
 
 		 203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1252  flagellar L-ring protein  38.81 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1203  flagellar L-ring protein  38.81 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0331  flagellar basal body L-ring protein-like protein  38.92 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  30.77 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  30.32 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  31.36 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  31.36 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  30.06 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  31.25 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  31.11 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  27.65 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  28.11 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  33.12 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  31.52 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  29.31 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  33.55 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  30.69 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  30.69 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  31.33 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  30.69 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  31.87 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  29.88 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  32.32 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  26.63 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  24.69 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  32.92 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.23 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  30.87 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  29.28 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  26.59 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  26.59 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  27.84 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  25.99 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  32.95 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  26.74 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  28.25 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  26.09 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  27.03 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  27.03 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  24.87 
 
 		 255 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0048  flagellar L-ring protein  25.17 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  30.12 
 
 		 244 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  25.66 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  30.54 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  30.68 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  26.26 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  25.66 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  28.57 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  27.03 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  24.57 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  27.15 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  27.22 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  28.48 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  24.06 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  30.56 
 
 		 235 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  27.21 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  31.21 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  26.4 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 240 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 240 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  25.32 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  28.25 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  29.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  28.05 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  28.85 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  28.05 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  24.54 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  28.48 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  27.47 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  25 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  28.67 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  24.54 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  27.47 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  24.87 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  28.67 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  26.79 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  26.92 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  26.92 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  24.73 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  26.92 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>