More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0412 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0412  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0790  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0813  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0179  beta-lactamase domain-containing protein  47.96 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00103774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.33 
 
 		 211 aa  98.2  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.61 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  32.5 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  29.82 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  30.14 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 246 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  29.49 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.77 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  27.75 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  29.23 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  27.4 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.66 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.85 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  30.29 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  32.79 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.41 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  27.4 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>