More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0346 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 560 aa  1117    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 666 aa  183  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 748 aa  181  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.49 
 
 		 659 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 		 668 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 657 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.2 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 660 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 559 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.63 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.64 
 
 		 626 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 		 713 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.07 
 
 		 643 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 628 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.28 
 
 		 628 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 		 563 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 		 662 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 994 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.24 
 
 		 660 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.55 
 
 		 626 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 660 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 		 658 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 538 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 		 658 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 411 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.06 
 
 		 549 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 650 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 650 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 		 658 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 698 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 626 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  28.83 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 568 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  31.59 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.04 
 
 		 676 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 656 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 661 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.76 
 
 		 630 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 656 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  32.31 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 663 aa  154  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 495 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.17 
 
 		 549 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  29.55 
 
 		 660 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  31.59 
 
 		 632 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.27 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  30.49 
 
 		 629 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  34.45 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 645 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  34.45 
 
 		 561 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  30.75 
 
 		 629 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 689 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.29 
 
 		 660 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 666 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 564 aa  151  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 495 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  29.83 
 
 		 658 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 564 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  29.97 
 
 		 712 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  29.97 
 
 		 712 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 495 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  29.02 
 
 		 696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  32.17 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.88 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  31.09 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 695 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.55 
 
 		 565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 		 625 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  31.77 
 
 		 629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 716 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 638 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  30.85 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 495 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 629 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  32.04 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 655 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 638 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 569 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>