More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0144 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 537 aa  1032    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 667 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 		 670 aa  193  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 667 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 748 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 666 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 668 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 		 571 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 660 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.07 
 
 		 660 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 689 aa  181  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.68 
 
 		 659 aa  177  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 657 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 571 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.12 
 
 		 660 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  33.86 
 
 		 660 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 660 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 661 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 656 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 656 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 661 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 664 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 664 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.24 
 
 		 572 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 655 aa  163  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 662 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 660 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  31.27 
 
 		 658 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 		 658 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.71 
 
 		 564 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  33.86 
 
 		 660 aa  160  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.31 
 
 		 658 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 565 aa  160  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  30.55 
 
 		 658 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  33.86 
 
 		 660 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  30.55 
 
 		 658 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  32.36 
 
 		 658 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 		 663 aa  158  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 465 aa  158  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 		 658 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 661 aa  156  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.83 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  31.83 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 525 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.66 
 
 		 640 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  31.02 
 
 		 660 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 678 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.92 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.98 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 654 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.25 
 
 		 588 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.28 
 
 		 695 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1300  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 578 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 		 660 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.03 
 
 		 660 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.88 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.6 
 
 		 658 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 739 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 566 aa  146  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  32.64 
 
 		 689 aa  146  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1046  methyl-accepting chemotaxis protein  28.12 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1125  methyl-accepting chemotaxis protein  28.12 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.39 
 
 		 540 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 519 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  31.32 
 
 		 660 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.86 
 
 		 437 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1024  methyl-accepting chemotaxis protein  27.86 
 
 		 575 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 		 583 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.1 
 
 		 540 aa  143  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 		 540 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 638 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  29.49 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.71 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.38 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>