More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0374 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  91.14 
 
 
271 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0287  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0741  hypothetical protein  36.36 
 
 
290 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
390 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  30.37 
 
 
371 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 
363 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
393 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
409 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  30.92 
 
 
405 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
405 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
405 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  33.73 
 
 
396 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 
409 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  30.43 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  29.33 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  30.43 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.92 
 
 
424 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  30.43 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  28.63 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  28.63 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  30.43 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  30.92 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  30.43 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.21 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.7 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.94 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  25.35 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  29.61 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  25.35 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  28.11 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  28.35 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.8 
 
 
373 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 
399 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  28.72 
 
 
412 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
377 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  32.91 
 
 
435 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  33.01 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.37 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  25.86 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  31.4 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  28.44 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
397 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  30.12 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 
416 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.38 
 
 
403 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  28.57 
 
 
414 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  26.23 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.38 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  29.22 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  32.2 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  26.22 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  31.07 
 
 
387 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  31.67 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 
407 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.32 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.18 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  28.14 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  27.76 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  30.62 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  27.76 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>