271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2410 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  68.98 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  51.88 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  46.84 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  50.19 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.42 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.07 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  48.19 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  42.75 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  40.59 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  45.71 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  41.2 
 
 		 274 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  40.96 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  37.55 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  40.32 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  36.67 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  37.36 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  38.99 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  38.75 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.11 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  34.81 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  35.45 
 
 		 449 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  36.97 
 
 		 448 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.88 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 443 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 443 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 443 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  36.7 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.98 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.25 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 		 445 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 446 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  38.75 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  34.07 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  35.42 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.92 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.89 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.62 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.15 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.15 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.73 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.22 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  36.84 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.81 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.64 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.49 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.81 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  23.18 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.53 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.48 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.53 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.18 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.2 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  26.45 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  24.11 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  24.84 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.75 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.11 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.36 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.95 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>