More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1214 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  51.63 
 
 
147 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  46.79 
 
 
162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  49.35 
 
 
151 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
169 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  44.16 
 
 
153 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
251 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  43.04 
 
 
152 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
143 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
148 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
147 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 
147 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
152 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 
143 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 
150 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
151 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
143 aa  89  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
151 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.94 
 
 
147 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
147 aa  86.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
141 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
147 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
146 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
146 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
148 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
147 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
162 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  85.5  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.17 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
161 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.29 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.28 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
136 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.34 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.39 
 
 
162 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
189 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
155 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
152 aa  79  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
189 aa  79  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
151 aa  79  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
143 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
144 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  30.97 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
156 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  33.76 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
166 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.26 
 
 
162 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
176 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
153 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
158 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
149 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
134 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
144 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  28.1 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
137 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  32.34 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  40.19 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  40.4 
 
 
135 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
148 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
149 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  44.09 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  37.38 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
150 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
148 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
105 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
153 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
147 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.89 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  29.88 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>