More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0809 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  74.56 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  54.58 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  53.85 
 
 		 290 aa  254  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  53.23 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  54.4 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  51.29 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  55.46 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  51.85 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  44.52 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  50.82 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.01 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  50.6 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  46.18 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  44.18 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  45.04 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  43.48 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  44.09 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  46.67 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  41.91 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  43.73 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  47.83 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  48.12 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  42.92 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  43.29 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  44.59 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  41.28 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  37.46 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  43.29 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.17 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  36.6 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  36.11 
 
 		 355 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.93 
 
 		 600 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34.55 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  35.78 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.91 
 
 		 751 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.03 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.79 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.11 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  34.35 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.75 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.39 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.39 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  33.49 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  31.42 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.36 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.07 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.88 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.86 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  27.86 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  32.47 
 
 		 328 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  29.88 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.31 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.91 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.8 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.67 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.8 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.86 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>