More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4170 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  65.59 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  58.17 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  56.38 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  54 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  52.29 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  45.53 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  34.29 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  32.17 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  38.36 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.2 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.23 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.25 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.89 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.89 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.52 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.98 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.61 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.87 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.76 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.8 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.63 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.03 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.17 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.73 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.57 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  24.79 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  26.5 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.15 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.33 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  28.63 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>