More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2820 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  100 
 
 
349 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.11 
 
 
343 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  62.9 
 
 
347 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  59.49 
 
 
354 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  59.26 
 
 
354 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  60.78 
 
 
344 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  56.23 
 
 
352 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
402 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  48.58 
 
 
384 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  47.86 
 
 
385 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  45.55 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
353 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  54.59 
 
 
247 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 
359 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  43.15 
 
 
359 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  43.15 
 
 
359 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  44.29 
 
 
359 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  36.8 
 
 
358 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  32.18 
 
 
347 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.71 
 
 
386 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
386 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
386 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.92 
 
 
389 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  44.3 
 
 
399 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  42.81 
 
 
359 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  42.81 
 
 
359 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  43.49 
 
 
359 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.32 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  42.76 
 
 
359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.05 
 
 
386 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.29 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  43.18 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  40.06 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  48.31 
 
 
346 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  33.15 
 
 
348 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 
386 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  39.53 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  40 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43.7 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  47.6 
 
 
371 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  42.56 
 
 
359 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.64 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  39.48 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.58 
 
 
388 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  43.85 
 
 
358 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  39.48 
 
 
363 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  48.79 
 
 
329 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
360 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  43.81 
 
 
363 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
388 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.57 
 
 
381 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  41.23 
 
 
369 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 
348 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
347 aa  192  7e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
355 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  47.83 
 
 
329 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.54 
 
 
355 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.57 
 
 
380 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.27 
 
 
331 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
355 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  43.78 
 
 
337 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1108  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.43 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.81433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.49 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.82 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 
423 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.52 
 
 
352 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  38.44 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 
386 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  40.83 
 
 
352 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 
331 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  39.81 
 
 
366 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.64 
 
 
379 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
352 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 
355 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.19 
 
 
384 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.35 
 
 
339 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  50 
 
 
391 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
359 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.19 
 
 
364 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
352 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  44.5 
 
 
350 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 
380 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  37.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.74 
 
 
384 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
384 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  39.51 
 
 
353 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
325 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 
387 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  32.94 
 
 
354 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>