More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1528 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  100 
 
 		 481 aa  952    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  64.04 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  64.58 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  55.2 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  53.74 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  53.44 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  50.68 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  51.27 
 
 		 483 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  51.54 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  50.87 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  50.89 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  51.15 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  48.63 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  51.94 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  50.57 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  47.47 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  48.61 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  48.39 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  51.26 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  49.03 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  48.03 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  45.94 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  48.38 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  49 
 
 		 482 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  49 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  49 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  48.52 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  45.21 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  45.18 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.15 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  45.23 
 
 		 458 aa  362  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  45.54 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  44.93 
 
 		 519 aa  353  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  43.86 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  45.43 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  44.52 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  41.14 
 
 		 459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  38.83 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.2 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  30.9 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  33.8 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  34.79 
 
 		 438 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.47 
 
 		 429 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  33.1 
 
 		 435 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  32.13 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.43 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.72 
 
 		 425 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.38 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  33.1 
 
 		 428 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.86 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.98 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.31 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.24 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.84 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.84 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.57 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  35.43 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  32.32 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  32.3 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.29 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.82 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.97 
 
 		 432 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.46 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.76 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.57 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.12 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  29.16 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.84 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.73 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.01 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  29.6 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.74 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.82 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  32.11 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.4 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.14 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  29.55 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.37 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.48 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.92 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.66 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  31.26 
 
 		 437 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.89 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  27.57 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.41 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.11 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  28.41 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  29.55 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  27.71 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  32.41 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  27.66 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  28.96 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>