More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09030 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  100 
 
 		 547 aa  1105    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  53.55 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  34.44 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  36.24 
 
 		 474 aa  260  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  30.49 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.43 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  29.55 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.83 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  29.4 
 
 		 465 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  28.54 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.6 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  29.18 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.73 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.74 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.88 
 
 		 428 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  27.74 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.46 
 
 		 435 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.15 
 
 		 446 aa  158  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  29.08 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.86 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  29.16 
 
 		 471 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.02 
 
 		 454 aa  156  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  29.74 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.14 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.6 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.06 
 
 		 438 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.4 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  28.27 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.05 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.92 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  28.27 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  30.41 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  28.27 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  27.63 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.98 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.5 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.02 
 
 		 438 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  27.7 
 
 		 491 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.3 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  30.83 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  28.03 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.6 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  29.38 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  27.76 
 
 		 425 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  27.76 
 
 		 425 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  30.68 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  27.11 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.18 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.38 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.84 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.3 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  27.29 
 
 		 435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  27.89 
 
 		 473 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  28.6 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.54 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.9 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  25.89 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.74 
 
 		 431 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  26.34 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.03 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  33.94 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.58 
 
 		 436 aa  134  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  29.63 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  29.8 
 
 		 449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.44 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.43 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  25.2 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  29.98 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  24.94 
 
 		 431 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  33.44 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  28.23 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  29.75 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  24.16 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  27.13 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.75 
 
 		 434 aa  124  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  27.67 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  24.84 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.83 
 
 		 434 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.88 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  27.2 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  27.88 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.61 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.89 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  26.82 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  25.38 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  27.9 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  30.92 
 
 		 403 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  26.08 
 
 		 484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25.68 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  26.05 
 
 		 460 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.89 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  24.1 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>