258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2176 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  100 
 
 
432 aa  890    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  28.76 
 
 
547 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  28.54 
 
 
501 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04590  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.92 
 
 
430 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00333842  hitchhiker  0.0000000448049 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  26.74 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  27.12 
 
 
554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  24.02 
 
 
438 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  24.42 
 
 
463 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  25.27 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  22.99 
 
 
428 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  21.72 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  24.92 
 
 
481 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  25.41 
 
 
478 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  22.9 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  25.22 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  23.27 
 
 
491 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  23.64 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  28.35 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  25 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  23.89 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  24.61 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  26.55 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  26.55 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  21.99 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  26.95 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  22.57 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.01 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  25.77 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  24.82 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  23.46 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  24.06 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  28.57 
 
 
513 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  25.15 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  24.85 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  24.41 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  27.1 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  24.15 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  25.26 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  24.15 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.06 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  23.72 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  23.18 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  25 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  25.36 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  24.15 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0750  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  23.74 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  28.65 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  24.35 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  23.77 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  23.28 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  22.49 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  23.27 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  21.19 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  20.93 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  22.76 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  25.29 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  27.92 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  22.4 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  23.37 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  26.79 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  23.2 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  29.32 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  29.53 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  24.79 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.95 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  26.24 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  25.16 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.93 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  23.24 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  22.57 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  26.17 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  26.17 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0835  trigger factor  28.04 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.45727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  25.41 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  23.97 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  25.41 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  25.41 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  23.86 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  30.43 
 
 
471 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  22.97 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  24.75 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  26.06 
 
 
447 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  23.76 
 
 
466 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  25.35 
 
 
436 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  22.13 
 
 
473 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  20.29 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  25.29 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  28.4 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  24.81 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  29.87 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  27.72 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  25 
 
 
435 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  19.68 
 
 
507 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  26.13 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  26.92 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>